1、缺乏税务风险管理的利益驱动
**，LT集团公司作为大型国有企业，其资源、资金、收益等许多方面仍由国资委把控，公司的成本开支、营业利润、所缴税款都属于国家拥有的经济资源。因而对于税务管理工作的认识，把公司纳税和上缴利润简单理解为是左口袋和右口袋的关系。基于此，公司的管理层对税务风险的管理工作有时是敷衍的状态，从心理上缺少对税法的敬畏感。加之政府在一些方面对公司决策采取行政干预，使公司可能产生抵触的心态，从而对税务管理也就听之任之了。
第二，LT集团公司同其他国有企业一样，缺乏防范税务风险的利益驱动。我国国有企业在20多年的改革进程中，逐步提倡建立“产权清晰、责权明确、政企分开、管理科学”的现代企业制度，但国有资产委员会作为出资方对国企的监督和管理仍以政绩导向为主，而未能完全实现向企业所有者利益导向的转变。长期以来，作为国有企业的管理者，国资委考察国有企业的参考标准往往是国有企业上缴的利税之和。国有企业领导为了完成目标，多申报、多纳税，而缺乏合理税收筹划的利益驱动，忽视公司的税务风险，企业的实际盈利能力下降。
2、内控机制不健全
税务管理层级不够高，应税事务人力资源配置较弱。LT集团公司一直未能对税务管理工作加以重视，公司税务管理工作的独立性和前置性有所欠缺。LT集团公司对各个业务部门配置的专业税务人员不足，未能建立起完整的税务信息搜集体系。在公司内部，各业务部门也未能与应税事务部门就涉税事项做好沟通，缺乏必要的联动协作，致使公司日常的税务风险管理工作不够顺畅，整个体系运行不够完善。
业务流程控制不够细化，不能实现涉税风险管理环节前移。LT集团公司在实际税务风险管理活动中，未能完全按照涉税部门风险评估一财务部门初步审核一风险管理部门复核把关一管理当局审定确认的程序，完善重大税务事项风险管理及报告工作规范。同时，公司在各项业务流程操作中，责任未能落实到具体责任人，使得公司的税务风险管理工作不严谨、不镇密。例如，对于公司的一些兼并重组业务，公司未能严格按照风险识别、分析、评估等步骤，对目标企业的涉税事项和风险加以精确度量，也未能客观地评估兼并重组业务对公司战略规划和未来效益的影响程度，从而使得公司风险报告的前瞻性程度不够，增加了公司未来可能产生的风险。
缺乏完善的税务风险监控机制，风险监控力度不够。税务风险管理体系末端的风险监控对于整个体系起到监督、反馈的作用。LT集团公司缺乏完善的税务风险监控机制，以及不能把税务风险监控工作做到常态化，使其并不能完全掌握税务风险信息，增加了税务风险再次发生的可能性。此外，公司虽设立了税务风险内控体系，但未能很好地完成内部审计定期评价工作，也没有把税务风险管理工作成效与税务风险工作人员的业绩加以联系，并作为一项重要的考评指标。
3、缺乏完善的人才引进和培养机制
专业的税务风险管理团队是控制税务风险的首要前提。在“营改增”政策的背景下，税务风险管理人员的素质是一项影响税务风险管理工作的重要因素，掌握会计、税务、风险管理等专业知识的复合型人才也越来越得到众多公司的重视，“单一型”人才在新环境下也感到力不从心。而LT集团公司由于不完善的人才引进机制，未能通过政策引才、事业引才、待遇引才、感情引才等各种方针来增加自身的人才队伍，使得其面临着税务风险管理人才短缺的窘境。
此外，公司对税务管理人员的专业培训不足。在“营改增”政策实施以后，LT集团公司面临着更为复杂的税务管理工作，税务管理人员需要对新政策不断学习，理解新的财税知识并掌握新的工作技能。而税务工作人员自行经常专业培训或经验交流的动力不强，就需要公司组织参加专业的培训活动。LT公司每年组织的税务专业培训较少，在培训过程中由于计划不详细、方法单一，加上培训后的考评制度不完善，使得公司的税务管理专业培训不能取得较好的成果，税务管理人员的素质未得到质的提高，间接地增加了企业的税务管理风险。
4、机构冗余，信息沟通不畅
LT集团公司规模庞大，拥有多家分公司、子公司，各个公司内部也横向设置了众多的管理部门。不同税务管理部门在涉税信息上面可能存在不沟通、不交流，再加上增值税本身要比营业税复杂的多，造成管理者之间涉税信息传递不通畅，形成了公司内部的税务信息壁垒。不同涉税部门之间，由于缺乏有效的信息沟通、传递渠道和传递方式，没有形成完整的涉税信息交流机制，使公司的税务管理工作出现漏洞，增加税务管理风险。
此外，LT集团公司缺乏与税务检查机关足够的沟通交流。相同税收政策，税务机关和企业的理解可能有所出入，不同的税务机关也许会出现差异，即使同一税务机关，其不同的税务工作人员的解读也存在不完全一致的可能性。如果不加强与税务机关的沟通，公司就不能充分理解税务机关关于税收政策的解释，在税务申报缴纳时可能就与税务机关产生冲突，增加公司的税务管理风险。